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僕の環境では FDT3 にアップグレードしたら使い物にならない程にパフォーマンスが悪くなりました｡ 色々と調べてみた結果､Eclipse 側の使用するメモリ量を増やしたら解決しましたよー 以下がその方法

/Applications/eclipse/Eclipse.app/Contents/MacOS/eclipse.ini 見つける､無ければ作る｡( Winの場合はインストールしたディレクトリにあるらしいです )

んでもって､-Xms( 初期ヒープサイズ ) と -Xmx( 最大ヒープサイズ ) を変更してやれば良いみたいです｡ 僕は

-Xms40m → -Xms256m -Xmx256m →-Xmx512m

これは､自分のマシンのメモリ量によっても変わるでしょうが､とりあえず -Xms ≦ -Xmx になってれば良いそうです｡僕はこれで FDT だけじゃなくて､PHPEclipse や Aptana のパフォーマンスも改善されました｡